Liên quan đến hồ sơ, thủ tục hải quan, chính sách thuế NK đối với hàng hóa thuộc đối tượng không chịu thuế theo từng giai đoạn, cụ thể từ 1/4/2015 đến ngày 5/6/2018. Theo đó, tại điểm c khoản 4 Điều 16 Thông tư 38/2015/TT-BTC quy định hồ sơ hải quan đối với hàng hóa NK thuộc đối tượng không chịu thuế thì ngoài các chứng từ nêu tại khoản 2 điều này, người khai hải quan nộp, xuất trình thêm: Hợp đồng bán hàng cho các DN chế xuất theo kết quả đấu thầu hoặc giá cung cấp hàng hóa không bao gồm thuế NK, thuế TTĐB, thuế GTGT đối với hàng hóa thuộc đối tượng không chịu thuế NK, thuế TTĐB, thuế GTGT (nếu có) phục vụ xây dựng nhà xưởng, văn phòng làm việc của DN chế xuất do các nhà thầu NK.

Về thủ tục hải quan, tại khoản 2 Điều 75 Thông tư 38/2015/TT-BTC quy định, trường hợp nhà thầu NK hàng hóa để xây dựng nhà xưởng, văn phòng, lắp đặt thiết bị cho DN chế xuất, sau khi bàn giao công trình cho DN chế xuất thì báo cáo lượng hàng hóa đã NK cho cơ quan Hải quan nơi quản lý DN chế xuất theo mẫu số 18/NTXD-DNCX/GSQL phụ lục V ban hành kèm theo Thông tư này.

Hoạt động nghiệp vụ tại Chi cục Hải quan Thái Bình (Cục Hải quan Hải Phòng). Ảnh: T.Bình

Theo Tổng cục Hải quan, về chính sách thuế, trường hợp nhà thầu NK hàng hóa từ nước ngoài để xây dựng nhà xưởng, văn phòng làm việc, lắp đặt thiết bị cho DN chế xuất đáp ứng quy định về hồ sơ, thủ tục hải quan tại điểm c khoản 4 Điều 16; khoản 2 Điều 75 Thông tư 38/2015/TT-BTC thì không phải kê khai, nộp thuế NK. Tuy nhiên, trường hợp nhà thầu NK hàng hóa từ nước ngoài để xây dựng nhà xưởng, văn phòng làm việc, lắp đặt thiết bị cho DN chế xuất không đáp ứng quy định về hồ sơ, thủ tục hải quan tại điểm c khoản 4 Điều 16 và khoản 2 Điều 75 Thông tư 38/2015/TT-BTC thì phải kê khai, nộp thuế NK.

Đối với giai đoạn từ ngày 5/6/2018 đến nay, về hồ sơ hải quan, tại khoản 5 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi, bổ sung Điều 16 Thông tư 38/2015/TT-BTC quy định ngoài hồ sơ hải quan quy định tại khoản 1 hoặc khoản 2 Điều này thì hàng hóa của các nhà thầu NK từ nước ngoài đưa trực tiếp vào khu phi thuế quan để xây dựng nhà xưởng, văn phòng, lắp đặt thiết bị theo kết quả đấu thầu phải nộp cho cơ quan Hải quan 1 bản chụp hợp đồng bán hàng vào khu phi thuế quan theo kết quả đấu thầu hoặc chỉ định thầu trong đó, quy định giá trúng thầu không bao gồm thuế nhập khẩu.

Liên quan đến thủ tục hải quan, tại khoản 51 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi bổ sung Điều 75 Thông tư 38/2015/TT-BTC quy định trường hợp nhà thầu NK hàng hóa để xây dựng nhà xưởng, văn phòng, lắp đặt thiết bị cho DN chế xuất thì thực hiện thủ tục hải quan tại chi cục hải quan quản lý DN chế xuất; nhà thầu NK thực hiện khai tờ khai hải quan NK theo hướng dẫn tại Phụ lục II ban hành kèm Thông tư này, chỉ tiêu “Phần ghi chú” khai thông tin số hợp đồng theo quy định tại điểm g khoản 3 Điều 16 Thông tư này và ngay khi được thông quan hàng hóa phải đưa trực tiếp vào DN chế xuất.

Sau 30 ngày kể từ ngày kết thúc hợp đồng thầu, DN chế xuất và nhà thầu NK báo cáo lượng hàng hóa đã NK cho cơ quan Hải quan nơi quản lý DN chế xuất theo mẫu số 20/NTXD-DNCX/GSQL Phụ lục V ban hành kèm Thông tư này.

Về chính sách thuế, trường hợp nhà thầu NK hàng hóa từ nước ngoài để xây dựng nhà xưởng, văn phòng làm việc, lắp đặt thiết bị cho DN chế xuất đáp ứng quy định về hồ sơ, thủ tục hải quan tại khoản 5 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi, bổ sung Điều 16 thông tư 38/2015/TT-BTC; khoản 51 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi, bổ sung Điều 75 thông tư 38/2015/TT- BTC thì không phải kê khai, nộp thuế NK.

Trường hợp nhà thầu NK hàng hóa từ nước ngoài để xây dựng nhà xưởng, văn phòng làm việc, lắp đặt thiết bị cho DN chế xuất không đáp ứng quy định về hồ sơ, thủ tục hải quan tại khoản 5 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi, bổ sung Điều 16 Thông tư 38/2015/TT-BTC; khoản 51 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi, bổ sung Điều 75 Thông tư 38/2015/TT-BTC thì phải kê khai, nộp thuế NK.

Đối với chính sách thuế GTGT, theo quy định tại Điều 2, 3, 5, khoản 20 Điều 5 Luật Thuế GTGT và khoản 20 Điều 4 Thông tư 219/2013/TT-BTC đã quy định rõ đối tượng chịu thuế, người nộp thuế GTGT.

Theo đó, chỉ trường hợp hàng hóa, dịch vụ được mua bán giữa nước ngoài với các khu phi thuế quan và giữa các khu phi thuế quan với nhau thì mới thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

Tổng cục Hải quan đề nghị Công ty TNHH Serveone Việt Nam đối chiếu với các quy định về hồ sơ, thủ tục hải quan, chính sách thuế NK, thuế GTGT hiện hành và tình hình thực tế tại công ty để thực hiện đúng quy định.