Thông tư quy định, nguồn kinh phí thực hiện Chương trình bao gồm: Ngân sách Nhà nước bố trí trong dự toán chi thường xuyên hàng năm; đóng góp của các tổ chức, doanh nghiệp tham gia Chương trình; tài trợ của các tổ chức, cá nhân trong và ngoài nước và nguồn kinh phí hợp pháp khác theo quy định của pháp luật.
Thông tư cũng quy định các mức chi cụ thể cho từng Chương trình Xúc tiến thương mại, trong đó nhiều khoản chi thuộc các hoạt động của Chương trình Xúc tiến thương mại miền núi, biên giới và hải đảo được hỗ trợ 100% kinh phí.
Cụ thể như công tác tổ chức phiên chợ hàng Việt từ khu vực sản xuất đến miền núi, biên giới, vùng sâu, vùng xa, vùng đồng bào dân tộc và hải đảo; tổ chức và phát triển hệ thống phân phối hàng Việt sang các khu vực biên giới với các nước có chung biên giới; hỗ trợ “Xây dựng và cung cấp thông tin thị trường biên giới, cửa khẩu của Việt Nam và các nước có chung biên giới”; hỗ trợ “Tổ chức hoạt động giao dịch thương mại và đưa hàng vào Khu kinh tế cửa khẩu”...
Thông tư này có hiệu lực từ 5-1-2015 và thay thế Thông tư số 88/2011/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn cơ chế tài chính hỗ trợ từ ngân sách nhà nước để thực hiện Chương trình Xúc tiến thương mại quốc gia.